A.S さん、こんにちは。スペース西です。
メールでご質問があったので、ここサポート掲示板で回答します。

＞1． マニュアルが無い？ので非常に分かり難いです。最初から躓いております。

自己学習の順番として
１．メニュー[ヘルプ]→[簡易ヘルプ]を読んでください
　特に「指標モード」と「グループ管理」が他ではないので大まかに理解してください
２・メニュー[ヘルプ]→[Ｑ＆Ａエージンエント]を実行してください
　個別の操作そ、マウスとキーボードを代行して実行します
３．ここユーザサポートへ質問投稿して下さい
　メールと異なり画像などを使って回答できます

＞1．任意の銘柄を選択・グループ毎に保存する方法はありますか？。
＞1．ミニチャートと連動しますか？。

ミニチャートを言われているのは、株羅針盤では「サムネイル」と呼んでいます。
任意銘柄やスクリーニング結果の銘柄をグループごとに保存できます。
又、保存したグループ毎にサムネイル表示できます。

Ｑ＆Ａエージェント
[グループ番号]→[サムネイル銘柄へグループ番号を付ける]
[グループ番号]→[ソート結果や複数選択めいがらへグループ番号を付ける]
[グループ番号]→[銘柄リストの表示をグループ番号で切り替える]
※質問項目を選択し、最後の質問をＷクリックするか[解答を連続実行する]をクリックしてください

⇒参考図１
グループ番号は[1,2,3,,9,A,B,C,,,Z]の三十数通りで、グループ名も自由に設定できます

＞1．チャートをカスタマイズしても保存されないで、勝手に内容が変わってしまう。
＞　　設定を保存するにはどうすれば良いのでしょう？。

指標モードを[ユーザ設定１]〜[ユーザ設定20]を選んでください。
チャートのカスタマイズを保存・復帰します。
初期値の[最適指標]は、プログラムで最適な指標を計算表示するので、ユーザ変更は無視されます。

⇒参考図２

＞1．チャートの表示期間は変更できますか？。日足なら、60日・90日・120日・240日・・・とかです。

はい、自由に変更できます。
チャートは左下で選択できます。直接数値入力も出来ます。
サムネイルは指標設定画面で選択できます。

⇒参考図３