登録銘柄が増えるに従い、軌道に要する時間、バックアップに要する時間、ソフト終了時間に関する時間が３分近くかかるようになりました。
時間を短縮する設定があれば、アドバイスをお願いします。

SarfBay さん、こんにちは。スペース西です。

＞時間を短縮する設定があれば、アドバイスをお願いします。

これはＰＣ能力により、かなり重くなります。

【起動】　これは対策がありません

【バックアップ】[〆：取引記録・マスタ]のみチェックで[株価データ]はチェックしない
⇒参考図１

【ソフト終了】　終了時の自動バックアップを[全マスタのみ保存]にする
⇒参考図２

上記は初期設定で、一番早い状態です。
すでにこの設定になっている場合、残念ですがこれ以上の高速化は望めません。